O IBJC tem uma larga experiência quer na gestão, quer no desenvolvimento de projectos co-financiados por programas comunitários. Ao longo da sua existência o IBJC tem desenvolvido projectos nacionais e transnacionais, em nome próprio ou em representação da CGTP-IN. Por outro lado, tem prestado apoio à CGTP-IN, concretamente, na gestão financeira e administrativa de projectos, desenvolvidos pelos diversos Departamentos.